Elle apparaît au fond d'une cuvette, enserrée dans vallon couvert de vignes. Comme ses voisines Salins-les-Bains et Poligny, elle est située au débouché d'une vallée (ou reculée) qui entaille profondément le plateau du Jura.  Cette reculée est fermée par une falaise de 240 mètres de haut. Arbois est traversée par la rivière Cuisance et fait partie du Revermont puisqu'elle se trouve au pied du plateau du Jura, à la sortie de la reculée des Planches dans laquelle la Cuisance prend sa source.

Le vignoble arboisien
Le terroir arboisien produit quelques-uns des meilleurs vins jurassiens, dont le vin jaune et le vin de paille en sont d'illustres représentants.
C'est l'activité dominante ; la renommée du vin d'Arbois est devenue indissociable du nom d'Henri Maire, qui l'a popularisé grâce à ses affiches Vin fou Henri Maire, disséminées dans toute la France.

Arbois est donc un lieu où la gastronomie a la part belle, où il faut bon s'arrêter au restaurant ou faire son marché dans les nombreuses boutiques.

Cinq cépages sont autorisés. Trois cépages typiquement jurassiens : le Poulsard (ou Ploussard), le Trousseau, le Savagnin ; et deux autres communs à plusieurs grands vignobles de France : le Chardonnay et le Pinot Noir.

La variété de ces cépages vous offre une gamme étonnante de vins : les vins rosés et rouges, le rosé d'Arbois, les vins rouges, les vins blancs, le Vin Jaune, le Vin de Paille, les Crémants et les méthodes traditionnelles (blanc ou rosé), les eaux de vie de marc ou de vin et le Macvin.